НДС по услугам оператора фискальных данных принимается к вычету на общих основаниях. ОФД облагают свои услуги налогом и предъявляют его покупателям в общеустановленном порядке (см. письмо ФНС от 28.06.2017 № СД-4-3/12469).
Условия вычета НДС вам напомнит статья «Что такое налоговые вычеты по НДС?».