При выявлении пересортицы, в результате которой обнаружены товары, не указанные в первоначальном счете-фактуре, составьте исправленный счет-фактуру. Корректировочный для данной ситуации не подходит. На это указывает Минфин России в Письме от 16.03.2015 № 03-07-09/13813.

О случаях, когда корректировочный счет-фактура потребуется, см. наш материал «Что такое корректировочный счет-фактура и когда он нужен?».