Если трудовые отношения с работником сохраняются, стандартный вычет по НДФЛ предоставляйте и за те месяцы, в которых доход ему не выплачивался. Это вновь подтвердила ФНС РФ в Письме от 29.05.2015 № БС-19-11/112.

Не так давно ведомство уже давало аналогичные разъяснения.

См. «Положен ли стандартный вычет по НДФЛ за «бездоходные» периоды?».