Если больничный назначен работнику в одном отчетном периоде по 6-НДФЛ, а выдан в следующем, отразите его в расчете периода фактической выплаты, а в периоде начисления не показывайте совсем, ни в первом, ни во втором разделе. Объяснение простое — для целей НДФЛ датой получения дохода в виде пособия по временной нетрудоспособности является дата выплаты. Поэтому оснований для включения пособия в период болезни / начисления нет.
Так, в расчет за 9 месяцев 2022 года не нужно включать пособие за первые 3 дня болезни, которые пришлись на сентябрь, но были оплачены в октябре. Они пойдут в расчет за год как в 1, так и во 2 раздел.
Пример заполнения 6-НДФЛ с больничным смотрите в КонсультантПлюс, оформив бесплатный пробный доступ:
Скачать бесплатно в КонсультантПлюс
См. также нашу статью.