Больничные пособия отражайте в 6-НДФЛ по факту выдачи денег, независимо от периода начисления. Ведь датой получения дохода в данном случае является дата выплаты (см. письма ФНС от 25.01.2017 № БС-4-11/1249@, от 22.09.2016 № БС-3-11/4348@).
Важно! Рекомендации от "КонсультантПлюс"
Сведения о пособии и удержанном из него НДФЛ нужно отразить (разд. III, IV, V Порядка заполнения расчета 6-НДФЛ, Письма ФНС России от 12.04.2021 N БС-4-11/4935@, от 01.04.2021 N БС-4-11/4351@):
в разд. 2 расчета за отчетный период, в котором оплачен больничный;
в разд. 1 расчета за отчетный период, в последние 3 месяца которого удержан НДФЛ с больничного;
в справке о доходах и суммах налога физлица (при заполнении расчета за налоговый период).
Построчный алгоритм и пример заполнения 6-НДФЛ с больничным смотрите в К+. Пробный доступ к системе можно получить бесплатно.
Так, пособия, начисленные в июне, а выданные в июле, в первый раз нужно включить именно в 6-НДФЛ за 3 квартал 2021 года. Это касается и 1-го и 2-го разделов расчета. Аналогично поступайте с сентябрьскими пособиями, выданными в октябре. Они пойдут в разделы 1 и 2 расчета за год.
Также о заполнении 6-НДФЛ с больничным, читайте эту статью.