Только по счетам-фактурам, выставленным исполнителем.
К таким выводам пришел Минфин в письме от 18.08.2017 № 03-07-11/53086. В соответствии с нормами НК РФ принять НДС к вычету можно только при одновременном соблюдении нескольких условий, в том числе при наличии подтверждающей первички и счета-фактуры с выделенным входным НДС.
Таким образом, наличие решения суда, обязывающего исполнителя выполнить определенные работы для заказчика, само по себе еще не дает заказчику права принимать НДС по таким работам к вычету.
О порядке учета и вычета НДС при строительстве — наша статья «Какой порядок учета и вычета НДС при строительстве основных средств?».