Если организация заключила с физлицом агентский договор, к примеру по сдаче в аренду его жилья, налоговым агентом по НДФЛ в отношении доходов «физика»-принципала она не является. Все дело в том, что источник доходов в данном случае не фирма-посредник, а фактические заказчики (в случае с арендой квартиры — наниматели). Это подтвердил Минфин в письме от 21.06.2018 № 03-04-06/42656.
Больше о том, кто является налоговым агентом по НДФЛ, узнайте здесь.