С 2025 года доплаты, обусловленные районным регулированием в виде коэффициентов и процентных надбавок (РКПН), являются отдельной налоговой базой по НДФЛ (п. 6.2 ст. 210 НК РФ) и облагаются налогом по отдельным ставкам (п. 1.2 ст. 224 НК РФ).
Подробнее читайте здесь.
ФНС отмечает, что эти доплаты участвуют в расчете среднего заработка, к примеру, для оплаты отпуска (ст. 139 ТК РФ, пунктом 2 Положения, утв. постановлением Правительства от 24.12.2007 № 922). А значит, часть выплаты, рассчитанная по средней зарплате, относящейся к суммам РКПН, нужно учитывать в налоговой базе, указанной в п. 6.2 ст. 210 НК РФ, и облагать НДФЛ по ставкам, предусмотренным п. 1.2 ст. 224 НК РФ.
Проще говоря, отпускные и пр. выплаты по средней нужно делить на две части: общую и «северную», рассчитываемую по РКПН.
Об этом — письмо ФНС от 28.01.2025 № БС-4-11/739@.
Больше об отпусках работникам Крайнего Севера читайте в готовом решении. Пробный доступ к «КонсультантПлюс» бесплатный.
Здесь пока сложно что-то конкретное ответить. Хорошо бы получить официальные разъяснения от чиновников по этим кодам.