Если работник направляется в командировку не от места работы (из отпуска, например), билет туда без проблем учитывается в составе командировочных расходов для налога на прибыль. Облагать его НДФЛ тоже не нужно.
Налогообложение обратного билета зависит от того, куда прибывает работник из командировки: если к месту работы, стоимость проезда также берется в расходы и освобождается от НДФЛ. Если же обратно к месту отпуска, тогда признать расходы для прибыли нельзя, а НДФЛ удержать необходимо.
Это следует из писем Минфина от 05.07.2019 № 03-03-06/1/49840, от 17.01.2017 № 03-04-06/1546.
Заметим, что разъясняя вопрос по НДФЛ в прошлый раз, чиновники настаивали, что налог нужно удерживать в том числе с билета к месту командировки (письмо от 21.02.2019 № 03-15-06/11330). Эти разъяснения мы приводили здесь. Как видим, в свежем письме ведомство вернулось к своей более ранней и более лояльной позиции.
См. также «Остаться в месте командирования на праздники работник может без уплаты НДФЛ».