Нет, не учитывать, говорит Минфин России.
Чиновники поясняют, что сомнительная задолженность возникает в связи с реализацией товаров, выполнением работ, оказанием услуг. Поэтому независимо от вероятности осуществления поставки перечисленные авансы нельзя учесть при создании резерва по сомнительным долгам (см. Письмо от 04.09.2015 № 03-03-06/2/51088).
Подробнее о создании резерва читайте в статье «Резерв по сомнительным долгам: порядок создания и расчет отчислений».