Если Вы НДС-ник, то с этих авансов наверное нужно начислить НДС и заплатить его в бюджет. У Вас какие-то сомнения на этот счет? Другое дело, что возможно выставление сводного счета-фактуры на аванс. Я сама с такой формой не сталкивалась, поэтому мне сложно говорить о ее заполнении.
Как быть с авансами, полученными от физических лиц?