Если суммы большие, то у налоговиков при проверке могут возникнуть вопросы, почему вы так долго возмещали эти расходы. Если суммы незначительны, то в принципе - почему нет, возмещайте. В статье, под которой вы оставили свой вопрос, достаточно подробно разъяснено о последствиях возмещениия расходов работнику без предварительной выдачи денег под отчёт.
Скажите пожалуйста имеем ли мы право возмести затраты в этом году за прошлый и позапрошлый год.