На АУСН можно иметь счета только в уполномоченных банках. Если это условие у вас соблюдено, то да - можно иметь счета в нескольких банках. Но основной поток платежей от клиентов логичней пустить через один расчетный счет, лично мое мнение. А остальные счета оставить в качестве вспомогательных.
Можно ли имея счета в нескольких банках и принимая платежи от клиентов на разные счета перейти на...