Сначала весь «входной» НДС нужно поставить к вычету, а после ввода объекта в эксплуатацию начать его восстановление в порядке ст. 171.1 НК РФ. Восстанавливать налог придется в течение 10 лет, ежегодно – исходя из 1/10 суммы вычета и доли ТРУ, проданных за год в рамках «вмененной» деятельности. Поступать так требует Минфин в письме от 01.12.2016 № 03-07-11/71110.

Об условиях вычета узнайте из статьи «Что такое налоговые вычеты по НДС?».