Дни командировки оплачиваются по среднему заработку. Для командированного за границу — это доход от источников в РФ, а для вас — выплата, с которой нужно удержать и перечислить НДФЛ в качестве налогового агента. Если на момент выплаты работник остается резидентом РФ, налог удержите по ставке 13%, если нет — по ставке 30% (письма Минфина от 12.10.2018 № 03-08-05/73477, от 26.03.2018 № 03-04-05/18898, от 11.10.2017 № 03-04-06/66426).
Если работник не командируется за границу, а постоянно работает там, его зарплата относится к доходам от источников за пределами РФ. У нерезидентов такой доход НДФЛ не облагается, а резиденты платят налог самостоятельно.
Подробнее о резидентском статусе читайте в этой статье.