На суммы пособий, которые ФСС отказался принимать к зачету (счел расходы необоснованными или нашел ошибки в документах), безопаснее начислить страховые взносы.
Такова позиция Минтруда (письмо от 26.02.2016 № 17-3/В-76) и иную придется отстаивать в суде.
Впрочем, все шансы для этого есть, ведь судьи считают иначе (см., например, определение ВС РФ от 23.11.2015 № 304-КГ15-14441).
Аргументы для спора ищите в публикации «А вы начисляете взносы на пособия, не зачтенные ФСС?».