По мнению Минфина, гендиректор, который является единственным участником ООО, не может сам с собой заключить трудовой договор. Для последнего необходимы 2 стороны: работник и работодатель, а в данном случае одна из сторон отсутствует.
Поэтому трудовые отношения с директором как с работником чиновники требуют оформлять не трудовым договором, а решением единственного участника (письмо от 15.03.2016 № 03-11-11/14234).
Подробнее о «трудовом» вопросе директора - учредителя и связанных с ним налоговых рисках читайте в статье «Можно ли учесть расходы на оплату труда и другие выплаты в пользу руководителя организации, являющегося ее единственным учредителем?».