Можно. Форма УПД из письма ФНС от 21.10.2013 № ММВ-20-3/96@ является рекомендованной. В нее можно добавлять любые необходимые показатели, в том числе и реквизиты, которыми за последнее время пополнился бланк счета-фактуры. Это подтвердила ФНС письмом от 14.09.2017 № ЕД-4-15/18322.
Более того, сделать это необходимо, если вы планируете использовать УПД по прямому назначению — как единый документ взамен первички и счета-фактуры. Иначе покупатель не сможет использовать его для вычета НДС.
Как заполнить новую форму счета-фактуры с октября 2017 года, читайте в этой статье.
Про универсальные передаточные документы читайте здесь.