Пожалуйста, можно ли вернуть уплаченные за патент суммы, если взносы в СФР были оплачены позже...

Если вы имеете ввиду взносы ИП (фиксированные или 1%), тогда вы можете подать заявление на уменьшение патента и у Вас образуется положительное сальдо на ЕНС, которое Вы сможете вернуть или зачесть. На будущее имейте в виду, что уменьшение патента на сумму взносов ИП происходит без учёта их фактической оплаты.
Если же Вы имеете в виду взносы за работников, то патент на них уменьшается только по оплате, см. подп. 1 п. 1.2 ст. 346.51 НК РФ. Поэтому если они были оплачены позже срока действия патента, то Вы не имеете права производить уменьшение.