Здравствуйте, сумму расходов, которые уменьшают доходы, вы формируете и указываете в калькуляторе самостоятельно. Поэтому не совсем понятно, что значит калькулятор "просчитал дополнительные 1% с доходов свыше 300.0 т.руб.". Если вы включили в расходы сумму страховых взносов 1% с доходов свыше 300 тыс. руб., то калькулятор ее учел.
Сделала контрольный расчет по вашему образцу(калькулятор).. но увы, он просчитал дополнительные 1%...