Юрлицо приобрело для нужд хозяйства легковой автомобиль но в связи с выявленным в процессе...

А вы наверное уже оприходовали у себя автомобиль, ввели в эксплуатацию и зарегистрировали на организацию, так? Если да, то тут уже будет операция по обратной реализации. Это мое мнение. И НДС в этом случае платить будет нужно как обычно с реализации, поскольку вы сами на общем режиме (я правильно этот момент поняла?). Задайте свой вопрос на нашем форуме Мне будет очень интересно услышать мнение других специалистов.