Лично не сталкивалась с такой ситуацией. Предлагаю посмотреть вот эту статью, в ней есть раздел, посвященный возврату переплаты, которая образовалась свыше 3 лет назад. Так же там вы найдете отсылки к письмам Минфина и судебной практике, надеюсь это хоть чем-нибудь поможет вам.
Насколько сложна процедура возврата переплаты налогов и взносов через суд(прошло более 3-х лет с...