Я написал заявление на отпуск на 3 календарных дня,заранее то есть мне надо было уехать 11,12,13,...

По закону ежегодный отпуск предоставляется по утверждённому графику отпусков (ст. 123 ТК РФ). Если вы хотите отпуск в другие даты — нужно письменное согласие работодателя. Просто подать заявление недостаточно: пока начальник его не подписал и не издан приказ — вы обязаны быть на работе.

Самовольный уход в отпуск, не предусмотренный графиком и не согласованный с работодателем, — это прогул (пп. «а» п. 6 ч. 1 ст. 81 ТК РФ).Прежде чем увольнять, работодатель обязан :

-составить акт об отсутствии на рабочем месте (комиссия минимум 3 человека);
-запросить у вас письменное объяснение (даётся в течение 2 рабочих дней);
-только после этого принять решение.

Если хотя бы один шаг пропущен — увольнение незаконно.

Формально он прав, но вы можете попытаться оспорить в суде его решение.