Если перепланировка увеличила площадь квартиры, но в пределах ее прежних границ, срок владения для продажи без НДФЛ (5 лет или 3 года) отсчитывайте с даты первичной регистрации права собственности. Перерегистрация собственности на перепланированный объект срок владения не прерывает и для НДФЛ никакого значения не имеет. Это подтвердил Минфин в письме от 19.07.2016 № 03-04-05/42227.

Обо все последних изменениях в части вычета при продаже жилья рассказывает наша статья «Налоговый вычет при продаже квартиры - изменения 2015».