Смотрите региональное законодательство, там написано исходя из чего рассчитывается патент. Насколько я помню в прошлом году был подобный вопрос про розничную торговлю из Вашего региона и мы нашли разъяснения о том, что в расчет берётся общая площадь помещений, а не только торгового зала.
В Краснодарском крае при расчёте патента берут площадь всего производства и торгового зала пекарни....