Тут нужно понимать, почему у Вас налог за 2-ой квартал был с минусом. И как Вы этот минус отразили в уведомлении об исчисленных суммах ЕНП. Налоговики в своё время давали разъяснение о том, что только в единственном случае налоговое уведомление по усн может быть с минусом, читайте об этом здесь Налог считается нарастающим итогом с начала года. И затем из полученной суммы вычитается сумма авансовых платежей за предшествующие отчётные периоды. В общем, Вам нужно сделать правильный расчёт.
Если налог по усн за 2 кв был за минусом, сейчас его вычесть? И если снова минус, не подавать...