Все зависит от того за счет чьих средств вы это сделали:
- за счет средств налогоплательщика. На основании абз. 2 п. 1 ст. 231 НК РФ налоговый агент обязан сообщить налогоплательщику о каждом ставшем известным ему факте и сумме излишне удержанного налога в течение 10 дней со дня его обнаружения. Вам нужно представить в налоговую заявление о возврате излишне перечисленной суммы или ее зачете (какое заявление вам напишет работник), в счет будущих выплат. Помимо заявления придется приложить регистры налогового учета свидетельствующие о переплате.
- за счет собственных средств. Вам нужно все равно заплатить налог, так как зачесть в счет переплаты вы ее не сможете и также подать заявление об образовавшейся переплате, приложив оправдательные документы.
Работнику вы кстати можете вернуть налог сразу или договорится с ним о зачете (если из его средств). Подробнее здесь
- за счет средств налогоплательщика. На основании абз. 2 п. 1 ст. 231 НК РФ налоговый агент обязан сообщить налогоплательщику о каждом ставшем известным ему факте и сумме излишне удержанного налога в течение 10 дней со дня его обнаружения. Вам нужно представить в налоговую заявление о возврате излишне перечисленной суммы или ее зачете (какое заявление вам напишет работник), в счет будущих выплат. Помимо заявления придется приложить регистры налогового учета свидетельствующие о переплате.
- за счет собственных средств. Вам нужно все равно заплатить налог, так как зачесть в счет переплаты вы ее не сможете и также подать заявление об образовавшейся переплате, приложив оправдательные документы.
Работнику вы кстати можете вернуть налог сразу или договорится с ним о зачете (если из его средств). Подробнее здесь