При компенсации отпуска (документ подтверждающий компенсацию есть) и отработке часов с 1 по 15...

Если человек работал, то он должен получить оплату за свой труд. Вы же пишите, что был отработан период 1 по 15 число и тут же пишите, что человек значился как в отпуске. Такого быть не может. Человек либо работал, либо не работал. Либо Вы с ним договариваетесь так, что ни у кого никаких вопросов и претензий не возникает. Если он работал - оплачиваете рабочие дни, в т.ч. посредством аванса. Если он не работал, а Вы его отправили в отпуск - тогда аванса быть не может, поскольку ему выдали отпускные. Но у Вас в вопросе указана компенсация, а не отпускные, Вам видимо самим нужно разобраться с оформлением документов.