При выборе УСН. Если будете выставлять своему заказчику документы с НДС, то Вам это будет не совсем выгодно, поскольку исходящий налог Вам платить придется, а вот входящий к вычету Вы принять не сможете. Но тут надо понимать насколько большой у Вас будет входящий налог. ПО УСН отчитываются один раз в год, по НДС - раз в квартал, но только в том случае, если в квартале будет проходить реализация с НДС. Если таковой не будет, то обязанности сдавать НДС не возникнет.
При выборе ОСН. Придется исчислять НДС и налог на прибыль ежеквартально, в некоторых случаях ежемесячно. Отчитываются также ежеквартально, по прибыли возможен вариант ежемесячной сдачи отчетности. Входящий НДС сможете принимать к вычету. Т.е в бюджет будете платить разницу между начисленным НДС (выставленным заказчику) и входящим - выделенным в документах Ваших поставщиков.
При выборе ОСН. Придется исчислять НДС и налог на прибыль ежеквартально, в некоторых случаях ежемесячно. Отчитываются также ежеквартально, по прибыли возможен вариант ежемесячной сдачи отчетности. Входящий НДС сможете принимать к вычету. Т.е в бюджет будете платить разницу между начисленным НДС (выставленным заказчику) и входящим - выделенным в документах Ваших поставщиков.