Квартира куплена в ноябре 2016 продана в апреле 2021 менее 5лет в собственности единственная...

Здравствуйте, аналогичная ситуация. Поделитесь, решили ли Вы уже вопрос с налоговой?

Я так понимаю, что отчитаться необходимо, но от налога должно быть освобождение, так как единственное жилье на момент продажи и 3 года успело пройти. (если бы прошло 5, то не нужно было бы вообще отчитываться).

Не нужно! Если гражданин продает свое единственное жилье, (комнату, квартиру, дом, или их части) которое находилось в собственности три года и более, налог при его продаже платить не нужно. Правило распространяются и на совместную собственность супругов.