Если Вы ИП на УСН, то у Вас НДС возникать не должен в силу применения спецрежима - см. п. 2 ст. 346.11 НК РФ. Если выставите счет-фактуру с НДС (например, по просьбе покупателя), то придется сдавать декларацию и платить налог в бюджет, естественно без вычетов.
ИП на УСН сдает в аренду помещения, аренда облагается НДС?