Мы являемся грузоотправителем и грузополучателем. Забираем груз последовательно у разных...

1. Можно ли на основании одного ЭЗЗ создать несколько ЭТрН?
Да, именно так и нужно делать. Одна ЭЗЗ объединяет весь рейс — со всеми адресами загрузки. А ЭТрН создаётся отдельная на каждый пункт погрузки. Объединить несколько точек погрузки в одной ЭТрН нельзя, даже если машина одна.

Правило: несколько грузоотправителей → один адрес выгрузки = ЭЗЗ и ЭТрН на каждую связку грузоотправителя и адреса выгрузки.

То есть в вашем случае: одна ЭЗЗ с 5 адресами загрузки - 5 отдельных ЭТрН.

2. В каждой ЭТрН прописать себя и ГО, и ГП?

Каждая ЭТрН оформляется на свою пару «грузоотправитель — грузополучатель»:

Грузоотправитель в каждой ЭТрН — тот контрагент, у которого забираете груз на данной точке (он владелец груза на момент отгрузки).
Грузополучатель во всех 5 ЭТрН — вы (поскольку вы получаете весь груз на своём складе).
Если вы выступаете экспедитором/организатором и сами нанимаете перевозчика, возможна схема, где вы — грузоотправитель (с признаком «является экспедитором»), а фактические поставщики указываются в адресах погрузки. Но базовый и самый прозрачный вариант: каждый поставщик — ГО в своей ЭТрН, вы — ГП во всех.

3. Где указывается адрес забора груза?
И в ЭЗЗ, и в ЭТрН — но по-разному:

В ЭЗЗ перечисляются все адреса пунктов погрузки (и выгрузки) с датами и временем. Формат ЭЗЗ это поддерживает — можно добавить несколько адресов погрузки через кнопку «Добавить».
В каждой ЭТрН указывается свой конкретный адрес погрузки — тот, который относится к данной накладной. При создании ЭТрН на основании ЭЗЗ вы выбираете нужный пункт погрузки из списка ранее добавленных адресов. Водитель видит в своём приложении 5 отдельных ЭТрН, у каждой — свой адрес загрузки. Так он понимает, к какой точке относится каждая накладная.

4. Обязательно ли загружаться в порядке из ЭЗЗ?
Строгого требования соблюдать очерёдность в ЭЗЗ нет, но есть нюанс:

В ЭЗЗ для каждого пункта погрузки указывается желаемое дата и время прибытия. Это ориентир для перевозчика, а не жёсткое требование. Если контрагент просит перенести загрузку на следующий день и перевозчик меняет очерёдность — ЭЗЗ нужно актуализировать: изменить дату/время погрузки для соответствующего пункта. Каждая ЭТрН живёт своим циклом: свой титул отправителя, свой титул приёмки водителем. Поэтому порядок подписания титулов водителем зависит от фактической очерёдности загрузки, а не от порядка в ЭЗЗ.