Из положений действующего законодательства следует, что организация должна вести воинский учет призывников и военнообязанных, работающих по трудовым договорам (ст. 8 Закона от 31.05.1996 № 61-ФЗ «Об обороне», ст. 8 Закона от 28.03.1998 № 53-ФЗ "О воинской обязанности и военной службе", п. 9 Положения о воинском учете, утв. Постановлением Правительства РФ от 27.11.2006 № 719). При этом в указанных НПА не содержится уточнения о том, что такой учет ведется только по основному месту работы. Среди лиц, которые не подлежат воинскому учету, совместители также не названы. Следовательно, работодатель должен вести воинский учет совместителей, если они относятся к лицам, подлежащим воинскому учету.
О том, кто подлежит воинскому учету в организации, мы рассказали в этой консультации.
Распространяется ли обязанность по ведению воинского учета на ИП-работодателей? Ответ вы можете узнать здесь.
Перейдя по этой ссылке, вы узнаете, нужен ли воинский учет в отношении сотрудников на ГПХ.
Хотелось бы получить более развёрнутый ответ.
Поэтому рекомендуем пока ориентироваться на позицию вашего военкомата (до момента, пока этот вопрос не будет четко урегулирован на законодательном уровне).