Правомерны ли действия ФНС в случае, когда налоговая начисляет НДФЛ для уплаты физическому лицу,...

Я правильно понимаю, что с сентября 2024 года по март 2025 года работник ходил на работу за просто так, то есть за полгода он не получил ни рубля? При этом он не обратился ни в трудовую инспекцию, ни в прокуратуру с заявлением о нарушении своих прав? В целом ситуация для нынешнего времени очень странная. Но если это так, то почему этот человек не может сейчас обратиться в организацию, где он работал с тем, чтобы уточнить, каким образом были произведены выплаты, которых он не получил. Это же легко проверяется. Если выплачивалась зарплата наличными денежными средствами, то должна стоять подпись работника в ведомости получения зарплаты. Если деньги перечислялись, то должны быть видны реквизиты банковского счета работника.
По вашему вопросу. Если в налоговую инспекцию налоговый агент подал сведения о том, что НДФЛ не был удержан с доходов физлица, то налоговая, конечно, до начислит этот НДФЛ и пришлёт физлицу уведомление о его уплате. Здесь ситуация конфликтная, поэтому Вам следует обратиться к грамотному юристу.