На больничный ушла фактически с первым днем отпуска. Тяжелая и длительная болезнь 78 дней...

Вам выплатили больничный, и это правильно. За один и тот же период невозможно получить и больничные, и отпускные. Дни отпуска за вами сохраняются. Однако ежегодный оплачиваемый отпуск должен быть продлен или перенесен на другой срок, ОПРЕДЕЛЯЕМЫЙ РАБОТОДАТЕЛЕМ с учетом пожеланий работника, в случаях: временной нетрудоспособности работника... Это ввдержка из ст. 124 ТК РФ.
Что касается компенсации за неиспользованный отпуск работающему сотруднику, то здесь не всё так просто. Её можно выплатить только с тех дней, что превышают стандартные 28 дней за каждый календарный год. Это из ст. 126 ТК РФ. Подробности ищите в этой статье.