А на что Вы собрались издавать приказ? Если он отсутствовал полный день можете поставить ему выходной, либо фактически отработанные часы, если он отсутствовал часть дня. Если в компании принято давать дополнительный отпуск на время посещения врача, то тогда он дополнительно пишет заявление и вы оформляете приказ.
Нужно издавать приказ если работник принес не больничный, а справку