ИП УСН6%, розничная торговля. Можно ли доход указывать за квартал одной суммой?

Доход в КУДИР указывается на основании первичных документов. У Вас один документ на всю сумму за квартал? Сильно сомневаюсь. Книга учета доходов и расходов является налоговым регистром, т.е. Вы в нее в хронологическом порядке вносите записи по полученных доходам, чтобы сформировать сумму за квартал, полугодие... и т.д. Это должно гарантировать отсутствие ошибок, а если они и закрадутся, то Вы сможете проверить по документам и при необходимости внести корректирующие записи. . Если же Вы внесете одну общую сумму, но ошибетесь, где потом будете искать свою ошибку?
Общую сумму Вы уже внесете в саму декларацию.