Ситуация такая, выплата зарплаты производится из кассы организации два раза в месяц (аванс и...

НДФЛ при выплате аванса уплачивать не нужно. Это объясняется тем, что согласно п.6 ст. 226 НК РФ НДФЛ перечисляется не позднее дня, следующего за днем выплаты налогоплательщику доходов. В соответствии с п.2 ст.223 НК РФ «датой получения дохода в виде оплаты труда признается последний день месяца, за который был начислен доход за выполненные трудовые обязанности в соответствии с трудовым договором (контрактом)». Таким образом, с точки зрения уплаты НДФЛ выплата аванса не является доходом. Аналогичные разъяснения приведены в письмах Письма ФНС от 29.04.2016 № БС-4-11/7893, от 15.01.2016 № БС-4-11/320, Минфина от 27.10.2015 № 03-04-07/61550, от 22.07.2015 № 03-04-06/42063.