Да, комиссия на эквайринг может учитываться в расходах при применении объекта УСН "доходы - расходы" по подп. 9 п. 1 ст. 346.16 НК РФ. Доходы учитываются в полной сумме с учётом эквайринга. Посмотрите эту статью, в ней мы пишем об учёте расходов на эквайринг. Ндс же считается не от поступивших сумма, а по отгрузке. Об определении базы для расчёта ндс и УСН, мы писали здесь
А если доходы-расходы розница 5%?
Комиссию по экварингу можем взять в расходы.
А в доходы усн тоже взять же?
А ндс тогда как?