Если проверка осуществляется в рамках реализации Вами основных и (или) дополнительных образовательных программ, предусмотренных лицензией, то полагаю, что оказание услуг в виде проверки знаний будет освобождаться от НДС. Но это мое мнение, возможно кто-то выскажет иную точку зрения.
НКО с лицензией на образовательную деятельность по договору с предприятием осуществляет проверку...