Положения о возможности уплаты налогов третьими лицами вступили в силу с 30.11.2016 г. Минфин пояснил, что они имеют обратную силу и распространяются на платежи, внесенные до этой даты. Например, если директор уплатил налог за организацию 3 ноября 2016 г., обязанность организации по уплате налога считается исполненной 03.11.2016 г. (письмо Минфина от 28.02.2017 № 03-02-08/11089).
Как правильно оформить платежку при уплате налога за третье лицо, см. здесь.