Если инвентаризация была проведена на УСН, то как Вы спишете и учтете недостачу на общем режиме? Я не совсем понимаю. Или Вы хотите оставить сальдо на счете 94, чтобы сделать списание в следующем налоговом периоде? На мой взгляд, это неправильно. Но решение принимаете Вы сами.
Можно ли недостачу списать и учесть в расходах на ОСНО?