Здравствуйте! Вам необходимо свериться с налоговой. Получив данные о том, что платежку зачислили не на тот КБК, который нужно, напишите заявление в произвольной форме об уточнении КБК и назначения платежа. Посмотрите, на форуме было подобное обсуждение:
Оплачивали пени по НДФЛ, указали КБК как при перечислении НДФЛ налоговым агентом. Что делать?