1) Неясно, кто подает декларацию. Если декларирует Друг, который поменял (продал) 1/2 долю квартиры, то он заявлет Доход в сумме договора, но не менее 70% от кадастровой стоимости соответствующей этой доле.
Если Наташа, то она декларирует доход в сумме продажи (мены) машины, если этого требуют срок владения ТС и Сумма продажи.
Наташа имеет право на имущественный вычет при покупке жилья. Вопрос о вычете именно за 2021 й год, так? Неясно, что значит "Вся квартира стоила 2 млн.руб."- к какому периоду применить эту информацию? Наташа имеет право на вычет в той сумме, которые она заплатила за свои доли. С первой 1/2 доли вычет будет по сумме покупки в 2016 г., а со второй 1/2 доли вычет равен сумме покупки (мены) в 2021 г., Складываете и заполняете в декларацию вычет за 2021 год, но в пределах общего лимита вычета 2 млн руб.
2) Не путайте вычеты с покупки и с продажи. Общий вычет с продажи 1 млн.руб. Вычет с продажи "единого" объекта по одному договору распределяется по долям: Наташе вычет 500 тыс. и сестре 500 тыс. Не по 2 млн, и не по 1 млн, а по 500 тыс. То есть 3 млн доход с продажи доома (на всех) минус вычет 1 млн (на всех), к уплате налог 13% с 2 млн (на всех).
Вместо вычета в 1 млн.на всех вы можете взять (каждый продавец) к вычету сумму расходов на покупки своих долей. К примеру, Наташа купила свою 1/2 долю за 1,2 млн. и сейчас продает за 1,5 млн. Тогда её налог будет 13% с разницы 300 тыс, т.е 39 тыс. руб. А сестра свою долю покупала за 700 тыс, тогда при продаже её налог будет (1,500-0,700)*13%= 104 тыс. руб.