Я думаю, что отправляя какую-либо сумму на пополнение ЕНС, стОит расписывать каждую копейку, иначе какое из обязательств Вы погашаете - налоговики не узнают.
Как по мне - я бы закидывала каждый платеж отдельно (мне было бы так удобно). Но как практика показывает- многие не заморачиваются