Посоветую обжаловать действия налоговой, если считает их неправомерными, обратившись в вышестоящий налоговый орган —УФНС вашего региона. Напишите жалобу, сейчас это довольно быстро можно электронно.
Кстати, исходя из ваших слов, уточненные декларации были подан за 2018-2019 годы, значит и налоги уплаченные "освободились" за те годы, а не за 2020 год, проверьте чтобы с даты уплат не прошло 3 года, иначе их вернуть уже будет нельзя.
А жалобу подайте, хуже не будет, можно и отозвать в любой момент, если что.