Да, получается видимо так. У нас УСН 6%, взносы вычитали конечно при расчете налога. Что же теперь...

Во-первых, пересчитать взносы верно и налог верно. Учитывая, что УСН 6% при наличии работников уменьшается только на 50%, то, возможно, у вас нет никакой недоплаты налога по УСН.

Если с УСН все в порядке, то я бы посмотрела на размер переплаты по взносам. Если она достаточно большая, то я бы сдала уточненки по расчету по взносам, зачла переплату по взносам и учла бы ее в периоде зачета при расчете аванса по УСН. Ну или вернула бы переплату, но не вижу в этом смысла - лучше зачесть. 

Если переплата по взносам небольшая, то я бы, честно, не стала сдавать такое большое количество уточненок. 

Если налог УСН занижен, то декларацию по УСН за 2020 год точно надо пересдать. Сначала пересчитываете взносы и налог УСН. Доплачиваете его в бюджет вместе с пени. Потом сдаете уточненку по УСН. Со взносами - так же, как и в случае, если налог по УСН не занижен. Авансы по УСН за 1 квартал просто пересчитаете, за полугодие уплатите аванс верно. Только копеечные пени набегут. 

Но если вы не будете сдавать уточненки по взносам, то переплату по взносам вы не сможете ни зачесть, ни вернуть.