Если штрафа опасаетесь и инспектора беспокоить не хотите, то в любом случае, не зная наверняка алгоритм действий в подобной ситуации, вы рискуете.
Я б позвонила. Допустим, у меня нет такой возможности. Как поступила бы я? Наверное, отменила бы переданные НЕДОСТОВЕРНЫЕ сведения. И, чтобы у инспектора не появилось недоумение в глазах, пояснила бы свои действия каким-то уведомлением или пояснительной запиской...
Чистая логика:
Допустим, вы оставите сведения, и пометите директора как совместителя. Предположим, что вы даже договор какой-то напишите с ним задним числом. А зарплата где? Тут-то уже до штрафа намного ближе становится. Трудовая инспекция может потребовать пояснения, копию договора...