Романыч, если в описанной ситуации квартира в собственности менее трех лет, то не имеет никакого значения есть у жены/мужа еще жилье, или нет, платить налог с ее продажи придется. От налога освобождены лишь квартиры, которые приобретены после 1 января 2016 года, находятся в собственности более 3 лет и являются единственным жильем.
Трехлетний срок ведет начало с момента первоначальной государственной регистрации права собственности на данную квартиру. И переоформление доли одного супруга на другого, не влияет на этот срок.
Если у любого их супругов в собственности имеется еще жилье, которое приобретено в браке, и является совместно нажитым, то при продаже квартиры, которой владеет второй супруг единолично,эта квартира не будет являться единственным жильем.