Простобух, средний заработок - средним заработком (не меньше), но всё же есть НО...
Если командировки частые, и средний заработок (вдруг) будет меньше дневной тарифной ставки - расходы по превышению надо будет обосновывать, и как Сергей подметил, что в ЛНА это надо закрепить (доплату до оклада в случае потери заработка).